Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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