Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms