Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc12Q8R344 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms