Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms