Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Hoxc12Q8K5B8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Hoxc12Q8K5B8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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