Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OptnQ8K3K8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OptnQ8K3K8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms