Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssh3Q8K330 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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