Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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