Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sde2Q8K1J5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms