Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pms1Q8K119 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms