Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit1Q8K099 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrit1Q8K099 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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