Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf628Q8CJ78 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms