Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms