Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms