Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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