Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms