Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms