Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms