Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C5C9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C5C9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms