Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccser1Q8C0C4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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