Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms