Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms