Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp38Q8BW70 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms