Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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