Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbfox3Q8BIF2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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