Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Htatsf1Q8BGC0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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