Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms