Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms