Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc172Q810N9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms