Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms