Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Prpf40bQ80W14 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf40bQ80W14 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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