Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms