Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Avl9Q80U56 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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