Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec16aQ80U30 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clec16aQ80U30 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms