Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccp110Q7TSH4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccp110Q7TSH4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccp110Q7TSH4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccp110Q7TSH4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms