Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms