Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrc2aQ7TSC1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms