Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Higd1cQ76I25 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms