Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SvoplQ6PDF3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms