Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mtss1lQ6P9S0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtss1lQ6P9S0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms