Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp49Q6P9L4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp49Q6P9L4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp49Q6P9L4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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