Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg16l2Q6KAU8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l2Q6KAU8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg16l2Q6KAU8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
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Atg16l2Q6KAU8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg16l2Q6KAU8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg16l2Q6KAU8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg16l2Q6KAU8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l2Q6KAU8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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