Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Msl2Q69ZF8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms