Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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