Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptpn13Q64512 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ptpn13Q64512 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ptpn13Q64512 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms