Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms