Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms