Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms