Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp1Q62209 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms