Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms